zfs安装与使用

Section 1

$ sed -i '3s/0.01/0.02/g' INCAR

精解：

1. 单引号中是我们的操作， 3s 表示的是选择第三行，因为我们知道 0.01 在第三行中出现，s 是substitute 的缩写;

2. 3s 后面跟一个斜杠 / 用来和后面被替换的内容分开，这里0.01 表示选择第三行的0.01;

3. 0.01后面再用一个斜杠，将其和替换后的数字分开(0.01 0.02 0.03 等)，表示将0.01替换为斜杠后面的内容;

4. 再加一个斜杠，后面的g 代表 global ，意思是全部替换。

5. 输入完毕后，我们选择要执行该命令的对象(要替换的文件)，也就是当前目录下INCAR 文件。

6. 命令的意思就是：我们用sed命令，将INCAR中的第三行的0.01全部替换成0.02。

7. -i 表示直接对源文件进行编辑，也就是说编辑之后源文件被新文件替换掉。因此，使用这个参数的时候要小心，小心，再小心。要格外小心！！！

Section 2

在课题刚刚开始的时候，就把slab模型中的原子按照层数（也就是z方向的大小）进行排列，前面我们讲过怎么sort坐标了，这里就不再啰嗦。

排列后的一个优势就是各个层的原子在POSCAR中的序号是连续的，可以很方便地进行选择然后通过使用sed 命令将POSCAR里面的T T T 批量转化为 F F F.

比如本例中：10-45为Ru原子，10-18， 19-27, 28-36， 37-45 从上往下数，分别对应第一、二、三、四层的Ru原子。

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46

Ru H 1.00000000000000 8.1377999784000004 0.0000000000000000 0.0000000000000000 4.0688999892000002 7.0475415119999996 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 21.5631999968999999 Ru H 36 1 Selective dynamics Direct 0.2212968850718230 0.2239409561475650 0.2936169649913790 F F F 0.2210036114118170 0.5561663540453879 0.2936884876706930 F F F 0.2212954084343650 0.8880992570872690 0.2936171801115680 F F F 0.5547059120221930 0.2208073369214740 0.2945957656788490 F F F 0.5547051050620690 0.5578229108467880 0.2945953069057910 F F F 0.5572530259134471 0.8880427972121010 0.2935860240494040 F F F 0.8910551675972660 0.2211397177458350 0.2944546614649750 F F F 0.8893412673473050 0.5559102687354450 0.2935156586054220 F F F 0.8893404937786400 0.8880862995751930 0.2935168781920150 F F F 0.1119432861914480 0.1106972088633780 0.1977748273385700 F F F 0.1112675774095350 0.4441060896203480 0.1977506775579700 F F F 0.1112675246777360 0.7779649556723670 0.1977514668340350 F F F 0.4440066349954530 0.1106943439331120 0.1977106006833940 F F F 0.4446549772136020 0.4443417041956370 0.1981365664070010 F F F 0.4440061461204080 0.7786377563630820 0.1977110173547200 F F F 0.7777009262273890 0.1113226147079440 0.1980782640541890 F F F 0.7777006933574599 0.4443146361556100 0.1980780083860340 F F F 0.7774653980933121 0.7779366397494840 0.1977260420610920 F F F 0.2222233413377670 0.2222233413358840 0.0992873228095945 F F F 0.2222233413377670 0.5555566746692190 0.0992873228095945 F F F 0.2222233413377670 0.8888900080025550 0.0992873228095945 F F F 0.5555566746710950 0.2222233413358840 0.0992873228095945 F F F 0.5555566746710950 0.5555566746692190 0.0992873228095945 F F F 0.5555566746710950 0.8888900080025550 0.0992873228095945 F F F 0.8888900080044310 0.2222233413358840 0.0992873228095945 F F F 0.8888900080044310 0.5555566746692190 0.0992873228095945 F F F 0.8888900080044310 0.8888900080025550 0.0992873228095945 F F F 0.1111100016643290 0.1111100016603930 0.0000000000000000 F F F 0.1111100016643290 0.4444433349937280 0.0000000000000000 F F F 0.1111100016643290 0.7777766683270571 0.0000000000000000 F F F 0.4444433349976650 0.1111100016603930 0.0000000000000000 F F F 0.4444433349976650 0.4444433349937280 0.0000000000000000 F F F 0.4444433349976650 0.7777766683270571 0.0000000000000000 F F F 0.7777766683310010 0.1111100016603930 0.0000000000000000 F F F 0.7777766683310010 0.4444433349937280 0.0000000000000000 F F F 0.7777766683310010 0.7777766683270571 0.0000000000000000 F F F 0.6419725686006360 0.3456803556224560 0.3432239557346220 T T T

在上面POSCAR基础上，放开上面的2层：

$ sed –i '10,27s/F/T/g' POSCAR

固定所有的Ru原子，可以：

$ sed –i '10,45s/T/F/g' POSCAR

Section 3

更一般的是匹配模式修改文件。

sed -i '/NFREE/s/^# //' INCAR ##取消注释NFREE

在这个命令中，/NFREE/ 是一个模式，表示匹配包含 “NFREE” 的行。s/^# // 是替换命令，将以 “#” 开头的行的开头的注释符号 “# “ 替换为空，即去掉注释符号。

sed -i '/^NCORE/s/^/#/' INCAR     ##添加注释

^NCORE表示匹配以 “NCORE” 开头的行。
s/^/#/：这是替换命令，将匹配到的行的开头加上注释符号 “# “。

sed -i '/^IBRION/s/.*/IBRION = 5/' INCAR  ##修改参数

/^IBRION/：这是一个模式，表示匹配以 “IBRION” 开头的行。
s/./IBRION = 5/：这是替换命令，将匹配到的行替换为 “IBRION = 5”。其中，./ 表示匹配任意字符序列，而 IBRION = 5 是替换的内容。

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